PFRMAT QA TARGET T0340 AUTHOR 2165-1648-9790 METHOD linear combination of alignment based constraints, METHOD undertaker cost functions, and consensus terms MODEL 1 QMODE 1 Zhang-Server_TS3 0.861 Zhang-Server_TS4 0.859 3Dpro_TS2 0.859 FOLDpro_TS1 0.859 Zhang-Server_TS5 0.857 SP3_TS1 0.857 SPARKS2_TS1 0.857 PROTINFO_TS4 0.857 beautshotbase_TS1 0.857 Ma-OPUS-server2_TS1 0.857 Ma-OPUS-server_TS2 0.857 BayesHH_TS1 0.857 FAMSD_TS1 0.857 FUNCTION_TS1 0.857 GeneSilicoMetaServer_TS1 0.856 HHpred2_TS1 0.856 HHpred1_TS1 0.856 Zhang-Server_TS1 0.856 Ma-OPUS-server_TS1 0.856 SP4_TS1 0.856 Zhang-Server_TS2 0.856 CaspIta-FOX_TS1 0.856 ROKKY_TS2 0.856 mGen-3D_TS1 0.855 nFOLD_TS1 0.855 RAPTOR-ACE_TS3 0.855 RAPTOR-ACE_TS1 0.854 RAPTOR-ACE_TS2 0.854 HHpred3_TS1 0.854 FORTE1_AL1 0.853 FORTE2_AL1 0.853 CIRCLE_TS2 0.853 FAMS_TS2 0.853 MetaTasser_TS1 0.853 panther2_TS1 0.853 karypis.srv_TS1 0.853 Pcons6_TS2 0.852 Pcons6_TS3 0.852 UNI-EID_expm_TS1 0.852 Pcons6_TS4 0.851 MIG_FROST_AL1 0.851 UNI-EID_bnmx_TS1 0.851 LOOPP_TS1 0.850 NN_PUT_lab_TS1 0.850 GeneSilicoMetaServer_TS2 0.849 Huber-Torda-Server_TS1 0.847 panther3_TS1 0.847 FAMSD_TS3 0.847 SAM-T02_AL1 0.847 UNI-EID_sfst_AL1 0.846 SAM_T06_server_TS2 0.845 ROBETTA_TS4 0.845 CIRCLE_TS3 0.844 FAMS_TS5 0.844 SAM_T06_server_TS1 0.842 FAMSD_TS2 0.840 FAMS_TS4 0.840 FUNCTION_TS3 0.840 gtg_AL2 0.839 MetaTasser_TS3 0.839 ROBETTA_TS5 0.838 FUNCTION_TS5 0.837 RAPTOR_TS1 0.837 FAMSD_TS4 0.836 MetaTasser_TS4 0.835 MetaTasser_TS2 0.834 ROBETTA_TS1 0.833 beautshot_TS1 0.832 Pcons6_TS1 0.832 Pcons6_TS5 0.832 FUNCTION_TS4 0.830 RAPTORESS_TS1 0.829 shub_TS1 0.827 CPHmodels_TS1 0.827 3Dpro_TS1 0.827 PROTINFO-AB_TS3 0.824 3D-JIGSAW_POPULUS_TS1 0.823 PROTINFO-AB_TS2 0.823 3D-JIGSAW_POPULUS_TS2 0.822 PROTINFO_TS5 0.822 FUNCTION_TS2 0.822 PROTINFO-AB_TS4 0.822 PROTINFO-AB_TS1 0.822 FOLDpro_TS5 0.821 3D-JIGSAW_TS1 0.820 FAMS_TS1 0.820 PROTINFO-AB_TS5 0.819 ROBETTA_TS3 0.819 FAMSD_TS5 0.816 3D-JIGSAW_RECOM_TS3 0.814 CIRCLE_TS4 0.813 FAMS_TS3 0.813 3Dpro_TS4 0.813 FOLDpro_TS4 0.813 PROTINFO_TS1 0.812 Ma-OPUS-server2_TS4 0.812 Pmodeller6_TS4 0.812 ROBETTA_TS2 0.812 PROTINFO_TS2 0.810 GeneSilicoMetaServer_TS3 0.809 RAPTOR_TS2 0.809 ROKKY_TS1 0.808 karypis.srv.2_TS1 0.806 CaspIta-FOX_TS3 0.805 3D-JIGSAW_POPULUS_TS4 0.805 RAPTORESS_TS2 0.805 3D-JIGSAW_RECOM_TS5 0.804 Pmodeller6_TS3 0.804 3Dpro_TS5 0.803 FOLDpro_TS3 0.803 keasar-server_TS3 0.803 Ma-OPUS-server_TS3 0.802 karypis.srv.2_TS4 0.800 karypis.srv.2_TS5 0.799 Bilab-ENABLE_TS4 0.799 CaspIta-FOX_TS2 0.799 CIRCLE_TS1 0.799 ROKKY_TS3 0.798 3Dpro_TS3 0.798 FOLDpro_TS2 0.798 karypis.srv_TS4 0.796 karypis.srv.2_TS2 0.796 Bilab-ENABLE_TS3 0.795 MetaTasser_TS5 0.795 SAM-T99_AL5 0.795 CIRCLE_TS5 0.795 ROKKY_TS4 0.793 3D-JIGSAW_POPULUS_TS3 0.793 keasar-server_TS4 0.793 CaspIta-FOX_TS5 0.793 FUGMOD_TS2 0.793 FUGMOD_TS1 0.792 GeneSilicoMetaServer_TS5 0.792 3D-JIGSAW_RECOM_TS4 0.792 Pmodeller6_TS1 0.792 Bilab-ENABLE_TS1 0.791 PROTINFO_TS3 0.790 LOOPP_TS2 0.789 Bilab-ENABLE_TS5 0.788 RAPTOR-ACE_TS4 0.787 RAPTOR-ACE_TS5 0.787 3D-JIGSAW_TS3 0.786 Ma-OPUS-server2_TS5 0.786 SP3_TS4 0.786 FORTE1_AL2 0.785 FORTE2_AL2 0.785 Pmodeller6_TS5 0.785 nFOLD_TS4 0.784 SP4_TS2 0.784 RAPTOR_TS5 0.784 Phyre-2_TS2 0.783 SP3_TS3 0.783 SPARKS2_TS2 0.783 Ma-OPUS-server2_TS2 0.783 SPARKS2_TS4 0.783 karypis.srv_TS2 0.783 SP3_TS2 0.783 SPARKS2_TS3 0.783 ROKKY_TS5 0.782 SP4_TS5 0.782 karypis.srv_TS3 0.782 Phyre-2_TS1 0.782 RAPTORESS_TS5 0.781 FUGUE_AL2 0.781 karypis.srv_TS5 0.781 Ma-OPUS-server_TS5 0.781 Phyre-2_TS3 0.780 SP3_TS5 0.779 SP4_TS4 0.779 Bilab-ENABLE_TS2 0.779 LOOPP_TS3 0.778 karypis.srv.2_TS3 0.778 Ma-OPUS-server_TS4 0.777 3D-JIGSAW_TS2 0.776 3D-JIGSAW_RECOM_TS2 0.776 3D-JIGSAW_TS4 0.776 SPARKS2_TS5 0.775 nFOLD_TS5 0.775 SP4_TS3 0.773 UNI-EID_bnmx_TS5 0.773 UNI-EID_sfst_AL5 0.773 gtg_AL1 0.772 SAM-T99_AL3 0.772 RAPTOR_TS3 0.770 LOOPP_TS5 0.769 FORTE1_AL5 0.769 forecast-s_AL4 0.769 keasar-server_TS1 0.769 keasar-server_TS2 0.769 FUGMOD_TS3 0.768 SAM-T99_AL4 0.768 UNI-EID_bnmx_TS2 0.767 UNI-EID_bnmx_TS3 0.767 gtg_AL4 0.767 nFOLD_TS2 0.766 Phyre-1_TS1 0.766 FUGUE_AL1 0.765 Ma-OPUS-server2_TS3 0.763 SAM-T02_AL2 0.763 forecast-s_AL1 0.762 SAM-T02_AL5 0.762 Huber-Torda-Server_TS4 0.761 Huber-Torda-Server_TS3 0.759 SAM-T99_AL2 0.759 UNI-EID_sfst_AL2 0.759 3D-JIGSAW_POPULUS_TS5 0.759 LOOPP_TS4 0.758 UNI-EID_sfst_AL4 0.758 3D-JIGSAW_TS5 0.756 FUGUE_AL3 0.756 nFOLD_TS3 0.756 GeneSilicoMetaServer_TS4 0.755 SAM-T99_AL1 0.754 3D-JIGSAW_RECOM_TS1 0.752 gtg_AL3 0.751 RAPTOR_TS4 0.749 RAPTORESS_TS4 0.748 FUGMOD_TS5 0.747 Huber-Torda-Server_TS2 0.747 FORTE1_AL3 0.746 FORTE2_AL3 0.746 CaspIta-FOX_TS4 0.744 RAPTORESS_TS3 0.742 SAM_T06_server_TS4 0.739 FUGUE_AL5 0.737 FORTE2_AL5 0.736 forecast-s_AL5 0.735 keasar-server_TS5 0.733 UNI-EID_sfst_AL3 0.733 SAM_T06_server_TS3 0.733 UNI-EID_bnmx_TS4 0.733 SAM_T06_server_TS5 0.732 Huber-Torda-Server_TS5 0.716 FORTE1_AL4 0.712 FORTE2_AL4 0.712 forecast-s_AL3 0.712 SAM-T02_AL4 0.702 Distill_TS2 0.701 Pmodeller6_TS2 0.700 Distill_TS1 0.694 forecast-s_AL2 0.692 Distill_TS3 0.685 SAM-T02_AL3 0.676 Phyre-2_TS5 0.673 Distill_TS4 0.665 Distill_TS5 0.657 gtg_AL5 0.633 FUGMOD_TS4 0.614 FUGUE_AL4 0.581 ABIpro_TS1 0.313 ABIpro_TS4 0.305 ABIpro_TS5 0.296 ABIpro_TS2 0.272 ABIpro_TS3 0.253 karypis.srv.4_TS4 0.207 karypis.srv.4_TS1 0.142 karypis.srv.4_TS3 0.140 FPSOLVER-SERVER_TS2 0.136 karypis.srv.4_TS5 0.127 karypis.srv.4_TS2 0.124 FPSOLVER-SERVER_TS5 0.121 FPSOLVER-SERVER_TS1 0.119 FPSOLVER-SERVER_TS4 0.097 FPSOLVER-SERVER_TS3 0.088 END