# TARGET YGR206W # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment YGR206W.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.008 0.003 0.008 0.043 0.186 0.751 2 N 0.015 0.012 0.018 0.104 0.284 0.567 3 N 0.015 0.011 0.014 0.191 0.299 0.470 4 N 0.020 0.013 0.023 0.382 0.180 0.382 5 V 0.007 0.002 0.014 0.891 0.044 0.042 6 E 0.007 0.001 0.019 0.902 0.050 0.022 7 E 0.008 0.002 0.017 0.899 0.054 0.020 8 L 0.006 0.001 0.012 0.929 0.034 0.018 9 L 0.005 0.001 0.024 0.898 0.048 0.024 10 R 0.005 0.001 0.025 0.860 0.064 0.045 11 R 0.006 0.001 0.017 0.829 0.060 0.086 12 I 0.021 0.005 0.014 0.505 0.138 0.317 13 P 0.034 0.006 0.030 0.306 0.199 0.426 14 L 0.093 0.012 0.078 0.344 0.241 0.233 15 Y 0.148 0.014 0.118 0.288 0.229 0.203 16 N 0.137 0.008 0.120 0.263 0.277 0.195 17 K 0.100 0.006 0.109 0.236 0.336 0.214 18 Y 0.056 0.021 0.062 0.225 0.344 0.294 19 G 0.037 0.011 0.060 0.123 0.464 0.305 20 K 0.059 0.010 0.052 0.123 0.427 0.330 21 D 0.070 0.022 0.047 0.101 0.389 0.371 22 F 0.101 0.031 0.032 0.078 0.421 0.338 23 P 0.093 0.014 0.036 0.132 0.318 0.408 24 Q 0.128 0.012 0.087 0.248 0.294 0.231 25 E 0.196 0.008 0.080 0.309 0.222 0.186 26 T 0.302 0.013 0.064 0.304 0.150 0.168 27 V 0.408 0.013 0.046 0.235 0.112 0.185 28 T 0.422 0.015 0.046 0.230 0.101 0.186 29 R 0.405 0.009 0.060 0.220 0.109 0.196 30 F 0.435 0.014 0.033 0.190 0.109 0.219 31 Q 0.337 0.016 0.023 0.126 0.148 0.351 32 M 0.171 0.011 0.031 0.117 0.238 0.431 33 P 0.083 0.010 0.069 0.142 0.299 0.396 34 E 0.069 0.007 0.173 0.195 0.321 0.235 35 F 0.104 0.016 0.101 0.202 0.305 0.272 36 K 0.080 0.020 0.054 0.132 0.256 0.459 37 L 0.051 0.019 0.050 0.126 0.264 0.490 38 P 0.033 0.008 0.103 0.132 0.295 0.427 39 A 0.052 0.013 0.167 0.178 0.302 0.288 40 L 0.070 0.015 0.098 0.187 0.299 0.331 41 Q 0.077 0.014 0.050 0.151 0.320 0.388 42 P 0.063 0.016 0.062 0.216 0.299 0.344 43 T 0.057 0.028 0.088 0.245 0.314 0.268 44 R 0.041 0.008 0.200 0.274 0.299 0.179 45 D 0.044 0.008 0.215 0.283 0.275 0.174 46 L 0.066 0.019 0.164 0.383 0.216 0.153 47 L 0.095 0.024 0.056 0.358 0.194 0.273 48 C 0.071 0.008 0.061 0.380 0.198 0.282 49 P 0.042 0.007 0.112 0.487 0.188 0.164 50 W 0.032 0.007 0.135 0.547 0.165 0.113 51 Y 0.036 0.006 0.170 0.510 0.196 0.083 52 E 0.046 0.006 0.153 0.452 0.247 0.095 53 E 0.034 0.006 0.119 0.456 0.252 0.134 54 C 0.033 0.008 0.085 0.468 0.266 0.140 55 D 0.040 0.005 0.061 0.300 0.348 0.245 56 N 0.094 0.009 0.050 0.231 0.301 0.314 57 I 0.243 0.015 0.054 0.252 0.227 0.209 58 T 0.381 0.012 0.049 0.203 0.155 0.200 59 K 0.554 0.009 0.046 0.163 0.095 0.134 60 V 0.553 0.011 0.042 0.179 0.082 0.132 61 C 0.563 0.008 0.033 0.161 0.086 0.149 62 Q 0.585 0.011 0.024 0.123 0.107 0.150 63 L 0.390 0.020 0.029 0.134 0.193 0.235 64 H 0.201 0.018 0.026 0.103 0.352 0.302 65 D 0.075 0.012 0.038 0.107 0.537 0.231 66 S 0.033 0.012 0.065 0.176 0.567 0.147 67 S 0.024 0.009 0.062 0.209 0.525 0.172 68 N 0.028 0.008 0.047 0.229 0.481 0.207 69 K 0.043 0.012 0.041 0.358 0.332 0.214 70 K 0.058 0.027 0.046 0.438 0.199 0.232 71 F 0.066 0.017 0.049 0.555 0.151 0.162 72 D 0.058 0.006 0.045 0.603 0.140 0.148 73 Q 0.049 0.004 0.041 0.725 0.096 0.084 74 W 0.036 0.004 0.034 0.804 0.066 0.056 75 Y 0.046 0.004 0.029 0.769 0.069 0.083 76 K 0.041 0.003 0.029 0.783 0.070 0.074 77 E 0.037 0.003 0.028 0.791 0.072 0.070 78 Q 0.041 0.004 0.028 0.737 0.084 0.106 79 Y 0.041 0.008 0.047 0.649 0.112 0.143 80 L 0.041 0.009 0.093 0.572 0.147 0.138 81 S 0.045 0.006 0.091 0.442 0.221 0.195 82 K 0.047 0.010 0.070 0.299 0.264 0.310 83 K 0.034 0.017 0.028 0.105 0.283 0.533 84 P 0.028 0.013 0.046 0.058 0.503 0.353 85 P 0.034 0.007 0.076 0.063 0.546 0.274 86 G 0.072 0.012 0.092 0.049 0.569 0.205 87 I 0.257 0.037 0.058 0.047 0.433 0.168 88 V 0.340 0.036 0.032 0.049 0.281 0.262 89 G 0.241 0.017 0.046 0.066 0.330 0.300 90 N 0.193 0.016 0.059 0.067 0.352 0.313 91 T 0.290 0.024 0.045 0.078 0.247 0.316 92 L 0.405 0.049 0.025 0.072 0.160 0.290 93 L 0.329 0.037 0.012 0.060 0.143 0.419 94 S 0.200 0.021 0.016 0.056 0.283 0.424 95 P 0.090 0.013 0.078 0.142 0.367 0.309 96 S 0.065 0.014 0.094 0.114 0.456 0.257 97 R 0.083 0.013 0.142 0.108 0.448 0.207 98 K 0.054 0.022 0.083 0.089 0.331 0.420 99 D 0.032 0.035 0.042 0.086 0.227 0.578 100 N 0.012 0.011 0.014 0.067 0.140 0.757 101 S 0.001 0.001 0.001 0.004 0.019 0.975