# TARGET YGR206W # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment YGR206W.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.996 2 N 0.012 0.012 0.011 0.236 0.005 0.066 0.658 3 N 0.008 0.006 0.022 0.358 0.181 0.139 0.286 4 N 0.008 0.011 0.023 0.523 0.117 0.125 0.194 5 V 0.008 0.003 0.023 0.774 0.035 0.060 0.096 6 E 0.011 0.003 0.039 0.816 0.024 0.039 0.068 7 E 0.013 0.002 0.057 0.823 0.024 0.043 0.038 8 L 0.016 0.003 0.047 0.846 0.014 0.048 0.026 9 L 0.019 0.007 0.039 0.821 0.017 0.061 0.036 10 R 0.024 0.002 0.031 0.737 0.021 0.143 0.042 11 R 0.030 0.004 0.029 0.598 0.068 0.152 0.120 12 I 0.064 0.021 0.024 0.356 0.146 0.036 0.354 13 P 0.085 0.021 0.037 0.280 0.082 0.079 0.417 14 L 0.079 0.023 0.077 0.350 0.068 0.148 0.254 15 Y 0.088 0.014 0.108 0.284 0.110 0.143 0.253 16 N 0.076 0.009 0.137 0.299 0.141 0.139 0.201 17 K 0.045 0.008 0.122 0.318 0.137 0.199 0.170 18 Y 0.028 0.015 0.099 0.210 0.144 0.315 0.190 19 G 0.025 0.009 0.088 0.106 0.160 0.322 0.289 20 K 0.039 0.013 0.086 0.097 0.227 0.249 0.290 21 D 0.043 0.027 0.065 0.103 0.263 0.193 0.307 22 F 0.040 0.018 0.026 0.074 0.271 0.063 0.507 23 P 0.039 0.014 0.027 0.048 0.110 0.109 0.652 24 Q 0.056 0.015 0.139 0.173 0.126 0.244 0.247 25 E 0.101 0.013 0.133 0.181 0.162 0.123 0.286 26 T 0.182 0.024 0.113 0.206 0.108 0.075 0.292 27 V 0.331 0.028 0.060 0.180 0.068 0.053 0.279 28 T 0.322 0.027 0.061 0.189 0.072 0.061 0.269 29 R 0.325 0.025 0.072 0.195 0.072 0.082 0.230 30 F 0.254 0.019 0.047 0.131 0.107 0.083 0.358 31 Q 0.173 0.025 0.049 0.115 0.157 0.089 0.393 32 M 0.094 0.016 0.032 0.073 0.171 0.036 0.579 33 P 0.078 0.010 0.081 0.081 0.091 0.133 0.527 34 E 0.115 0.019 0.142 0.086 0.106 0.181 0.352 35 F 0.130 0.028 0.094 0.078 0.140 0.098 0.432 36 K 0.123 0.034 0.053 0.078 0.126 0.085 0.500 37 L 0.058 0.017 0.030 0.065 0.165 0.034 0.632 38 P 0.052 0.016 0.076 0.061 0.058 0.125 0.612 39 A 0.044 0.016 0.104 0.069 0.096 0.197 0.474 40 L 0.052 0.036 0.076 0.076 0.189 0.104 0.467 41 Q 0.043 0.017 0.033 0.059 0.238 0.056 0.555 42 P 0.030 0.012 0.055 0.083 0.163 0.130 0.527 43 T 0.033 0.021 0.129 0.102 0.125 0.145 0.446 44 R 0.030 0.009 0.279 0.163 0.131 0.196 0.192 45 D 0.047 0.009 0.252 0.179 0.109 0.163 0.241 46 L 0.061 0.028 0.197 0.196 0.115 0.148 0.255 47 L 0.086 0.048 0.067 0.216 0.136 0.126 0.321 48 C 0.052 0.016 0.042 0.233 0.140 0.064 0.454 49 P 0.031 0.011 0.103 0.395 0.075 0.185 0.200 50 W 0.023 0.012 0.139 0.450 0.054 0.172 0.151 51 Y 0.016 0.009 0.184 0.515 0.056 0.088 0.132 52 E 0.022 0.003 0.160 0.503 0.064 0.174 0.073 53 E 0.023 0.006 0.141 0.448 0.059 0.235 0.088 54 C 0.020 0.022 0.104 0.402 0.110 0.136 0.206 55 D 0.023 0.008 0.081 0.377 0.106 0.241 0.163 56 N 0.036 0.007 0.061 0.314 0.143 0.254 0.184 57 I 0.064 0.014 0.047 0.466 0.091 0.107 0.212 58 T 0.118 0.014 0.047 0.483 0.065 0.074 0.197 59 K 0.170 0.010 0.063 0.476 0.071 0.067 0.143 60 V 0.230 0.014 0.060 0.430 0.054 0.073 0.140 61 C 0.304 0.016 0.054 0.307 0.068 0.071 0.180 62 Q 0.392 0.034 0.037 0.218 0.057 0.068 0.194 63 L 0.270 0.030 0.031 0.175 0.105 0.072 0.317 64 H 0.180 0.021 0.031 0.147 0.171 0.106 0.343 65 D 0.047 0.014 0.049 0.222 0.232 0.183 0.252 66 S 0.018 0.008 0.062 0.264 0.184 0.242 0.223 67 S 0.015 0.005 0.056 0.243 0.146 0.354 0.182 68 N 0.017 0.007 0.050 0.227 0.182 0.244 0.272 69 K 0.025 0.010 0.047 0.419 0.166 0.123 0.209 70 K 0.033 0.016 0.044 0.545 0.081 0.092 0.189 71 F 0.023 0.010 0.047 0.641 0.054 0.070 0.155 72 D 0.025 0.005 0.046 0.689 0.044 0.070 0.122 73 Q 0.020 0.003 0.046 0.777 0.031 0.065 0.059 74 W 0.014 0.003 0.031 0.820 0.030 0.052 0.049 75 Y 0.016 0.004 0.031 0.800 0.028 0.055 0.066 76 K 0.019 0.003 0.041 0.770 0.028 0.071 0.068 77 E 0.019 0.003 0.060 0.722 0.035 0.090 0.070 78 Q 0.019 0.004 0.077 0.629 0.048 0.135 0.089 79 Y 0.027 0.018 0.080 0.520 0.063 0.146 0.145 80 L 0.030 0.013 0.098 0.404 0.078 0.170 0.208 81 S 0.036 0.005 0.083 0.239 0.123 0.296 0.218 82 K 0.042 0.010 0.047 0.130 0.249 0.208 0.315 83 K 0.037 0.022 0.013 0.056 0.359 0.041 0.472 84 P 0.030 0.014 0.011 0.021 0.105 0.029 0.789 85 P 0.044 0.013 0.091 0.059 0.146 0.332 0.314 86 G 0.074 0.014 0.131 0.055 0.164 0.295 0.268 87 I 0.165 0.051 0.121 0.074 0.145 0.108 0.337 88 V 0.276 0.046 0.064 0.085 0.109 0.137 0.283 89 G 0.205 0.021 0.078 0.084 0.134 0.228 0.249 90 N 0.209 0.014 0.093 0.097 0.150 0.156 0.281 91 T 0.320 0.033 0.072 0.110 0.122 0.111 0.232 92 L 0.338 0.033 0.055 0.111 0.112 0.106 0.245 93 L 0.270 0.050 0.026 0.094 0.169 0.060 0.332 94 S 0.138 0.028 0.016 0.077 0.146 0.043 0.554 95 P 0.050 0.009 0.084 0.176 0.105 0.139 0.437 96 S 0.039 0.022 0.125 0.177 0.132 0.168 0.338 97 R 0.042 0.011 0.149 0.202 0.146 0.155 0.295 98 K 0.041 0.008 0.085 0.196 0.176 0.175 0.318 99 D 0.029 0.019 0.046 0.133 0.181 0.176 0.416 100 N 0.015 0.010 0.014 0.056 0.014 0.113 0.777 101 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998