# TARGET YCL023C # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment YCL023C.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.991 2 A 0.071 0.031 0.013 0.347 0.003 0.034 0.501 3 R 0.067 0.008 0.038 0.438 0.088 0.080 0.282 4 A 0.099 0.007 0.063 0.499 0.059 0.071 0.201 5 L 0.143 0.007 0.068 0.498 0.064 0.073 0.148 6 M 0.174 0.010 0.054 0.513 0.059 0.063 0.128 7 L 0.190 0.011 0.055 0.491 0.059 0.048 0.146 8 R 0.198 0.007 0.045 0.498 0.060 0.062 0.132 9 K 0.156 0.009 0.043 0.501 0.061 0.072 0.158 10 L 0.122 0.016 0.048 0.466 0.086 0.071 0.192 11 D 0.096 0.012 0.047 0.439 0.091 0.107 0.208 12 L 0.053 0.013 0.052 0.452 0.100 0.129 0.201 13 A 0.023 0.005 0.043 0.406 0.102 0.300 0.123 14 G 0.021 0.003 0.042 0.267 0.104 0.436 0.126 15 A 0.040 0.013 0.039 0.299 0.152 0.109 0.349 16 T 0.072 0.020 0.050 0.350 0.108 0.096 0.305 17 K 0.073 0.010 0.072 0.492 0.076 0.111 0.166 18 A 0.075 0.011 0.091 0.510 0.066 0.101 0.145 19 Q 0.081 0.008 0.096 0.507 0.061 0.128 0.119 20 C 0.114 0.014 0.066 0.461 0.069 0.122 0.154 21 F 0.111 0.015 0.064 0.473 0.068 0.101 0.169 22 T 0.136 0.007 0.051 0.396 0.092 0.140 0.178 23 K 0.104 0.014 0.044 0.369 0.118 0.160 0.190 24 L 0.101 0.021 0.020 0.221 0.213 0.047 0.377 25 P 0.102 0.009 0.042 0.196 0.097 0.117 0.438 26 W 0.135 0.019 0.098 0.262 0.092 0.151 0.243 27 A 0.167 0.015 0.115 0.253 0.104 0.118 0.229 28 Y 0.206 0.015 0.095 0.273 0.094 0.113 0.202 29 S 0.252 0.015 0.061 0.267 0.096 0.097 0.213 30 T 0.246 0.014 0.057 0.266 0.095 0.093 0.228 31 R 0.273 0.014 0.047 0.327 0.085 0.079 0.175 32 W 0.310 0.021 0.045 0.294 0.075 0.078 0.177 33 F 0.261 0.020 0.052 0.331 0.062 0.084 0.191 34 S 0.213 0.014 0.087 0.303 0.085 0.118 0.180 35 S 0.155 0.009 0.109 0.275 0.130 0.173 0.149 36 R 0.143 0.013 0.102 0.226 0.132 0.203 0.181 37 M 0.142 0.017 0.070 0.176 0.142 0.246 0.206 38 G 0.146 0.015 0.058 0.102 0.142 0.284 0.254 39 L 0.193 0.018 0.066 0.109 0.154 0.188 0.274 40 G 0.280 0.024 0.053 0.094 0.137 0.157 0.255 41 I 0.374 0.032 0.043 0.093 0.110 0.077 0.269 42 R 0.370 0.028 0.036 0.078 0.104 0.090 0.294 43 H 0.242 0.015 0.051 0.090 0.151 0.168 0.282 44 S 0.199 0.011 0.048 0.076 0.213 0.198 0.255 45 H 0.233 0.011 0.041 0.067 0.219 0.145 0.284 46 T 0.427 0.009 0.021 0.055 0.151 0.046 0.291 47 A 0.727 0.009 0.007 0.038 0.049 0.012 0.158 48 V 0.866 0.005 0.004 0.042 0.016 0.004 0.063 49 V 0.925 0.003 0.003 0.034 0.005 0.002 0.029 50 L 0.931 0.002 0.004 0.041 0.003 0.002 0.016 51 V 0.946 0.001 0.003 0.028 0.003 0.002 0.015 52 I 0.912 0.002 0.006 0.037 0.006 0.004 0.032 53 Y 0.853 0.005 0.010 0.049 0.018 0.013 0.052 54 V 0.582 0.008 0.057 0.151 0.038 0.053 0.110 55 S 0.319 0.009 0.123 0.217 0.095 0.094 0.143 56 T 0.264 0.006 0.118 0.248 0.102 0.153 0.108 57 I 0.229 0.014 0.084 0.270 0.081 0.212 0.110 58 I 0.221 0.023 0.038 0.274 0.138 0.090 0.216 59 K 0.167 0.009 0.038 0.216 0.154 0.085 0.332 60 P 0.141 0.005 0.055 0.288 0.101 0.179 0.229 61 I 0.221 0.010 0.052 0.381 0.070 0.090 0.176 62 H 0.280 0.009 0.028 0.439 0.060 0.037 0.148 63 V 0.294 0.008 0.025 0.521 0.024 0.035 0.093 64 Y 0.261 0.004 0.016 0.607 0.019 0.036 0.058 65 C 0.150 0.003 0.015 0.732 0.019 0.023 0.057 66 T 0.098 0.003 0.011 0.798 0.022 0.021 0.046 67 L 0.066 0.003 0.008 0.862 0.015 0.021 0.025 68 Y 0.032 0.001 0.006 0.927 0.008 0.014 0.012 69 Y 0.022 0.001 0.005 0.946 0.007 0.011 0.008 70 A 0.019 0.001 0.009 0.941 0.007 0.016 0.007 71 I 0.015 0.001 0.009 0.943 0.006 0.020 0.006 72 L 0.015 0.001 0.009 0.933 0.008 0.025 0.010 73 R 0.015 0.001 0.011 0.889 0.015 0.058 0.012 74 C 0.023 0.001 0.013 0.861 0.014 0.066 0.021 75 C 0.051 0.004 0.011 0.838 0.016 0.043 0.037 76 I 0.066 0.002 0.009 0.851 0.018 0.023 0.030 77 Q 0.099 0.002 0.009 0.826 0.015 0.026 0.024 78 I 0.115 0.003 0.010 0.816 0.014 0.022 0.020 79 Y 0.174 0.002 0.010 0.766 0.012 0.020 0.017 80 I 0.228 0.002 0.017 0.690 0.012 0.028 0.024 81 F 0.301 0.002 0.025 0.578 0.018 0.052 0.024 82 F 0.458 0.003 0.021 0.390 0.027 0.060 0.041 83 F 0.385 0.006 0.026 0.410 0.041 0.064 0.069 84 S 0.399 0.006 0.023 0.323 0.066 0.078 0.105 85 F 0.322 0.007 0.031 0.419 0.052 0.074 0.095 86 H 0.320 0.007 0.022 0.453 0.062 0.045 0.092 87 V 0.317 0.008 0.021 0.519 0.029 0.037 0.068 88 V 0.291 0.006 0.015 0.546 0.024 0.053 0.064 89 F 0.230 0.007 0.019 0.562 0.036 0.058 0.087 90 K 0.155 0.004 0.024 0.606 0.055 0.050 0.107 91 R 0.082 0.003 0.032 0.727 0.047 0.051 0.057 92 A 0.101 0.003 0.032 0.754 0.027 0.034 0.048 93 L 0.149 0.006 0.024 0.724 0.016 0.042 0.038 94 L 0.179 0.004 0.017 0.704 0.021 0.036 0.039 95 L 0.210 0.003 0.019 0.665 0.023 0.036 0.044 96 R 0.199 0.003 0.021 0.660 0.030 0.043 0.044 97 L 0.218 0.004 0.031 0.602 0.030 0.052 0.062 98 R 0.206 0.004 0.040 0.579 0.047 0.061 0.063 99 Y 0.228 0.004 0.044 0.521 0.050 0.086 0.067 100 A 0.217 0.006 0.038 0.505 0.053 0.081 0.100 101 F 0.247 0.011 0.028 0.435 0.079 0.088 0.112 102 S 0.284 0.011 0.019 0.322 0.093 0.087 0.183 103 C 0.205 0.014 0.024 0.307 0.109 0.089 0.251 104 T 0.193 0.016 0.029 0.301 0.098 0.088 0.275 105 A 0.100 0.010 0.048 0.379 0.096 0.125 0.241 106 R 0.063 0.010 0.048 0.420 0.114 0.124 0.221 107 E 0.053 0.010 0.048 0.463 0.117 0.113 0.196 108 K 0.047 0.009 0.043 0.453 0.086 0.100 0.262 109 K 0.046 0.007 0.064 0.416 0.083 0.144 0.241 110 N 0.060 0.006 0.078 0.341 0.121 0.187 0.207 111 E 0.102 0.009 0.066 0.328 0.136 0.126 0.234 112 M 0.144 0.016 0.043 0.257 0.131 0.101 0.309 113 F 0.165 0.019 0.024 0.215 0.135 0.125 0.317 114 S 0.101 0.019 0.013 0.141 0.009 0.131 0.586 115 F 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.997