# TARGET YBR221W-A # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment YBR221W-A.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 2 F 0.174 0.043 0.010 0.040 0.006 0.032 0.695 3 S 0.262 0.020 0.018 0.039 0.137 0.051 0.474 4 H 0.350 0.010 0.025 0.048 0.097 0.055 0.415 5 F 0.435 0.017 0.016 0.047 0.093 0.021 0.370 6 E 0.469 0.033 0.015 0.047 0.047 0.016 0.374 7 V 0.292 0.055 0.026 0.084 0.071 0.035 0.437 8 S 0.167 0.019 0.037 0.097 0.110 0.115 0.454 9 E 0.055 0.013 0.046 0.099 0.218 0.312 0.258 10 N 0.027 0.014 0.034 0.082 0.297 0.237 0.309 11 R 0.026 0.018 0.016 0.042 0.334 0.052 0.512 12 P 0.022 0.016 0.034 0.049 0.141 0.133 0.604 13 R 0.031 0.019 0.062 0.063 0.120 0.194 0.511 14 K 0.028 0.029 0.057 0.067 0.231 0.108 0.479 15 Q 0.024 0.015 0.027 0.066 0.206 0.043 0.619 16 P 0.026 0.009 0.049 0.112 0.103 0.117 0.584 17 R 0.040 0.016 0.097 0.155 0.102 0.149 0.441 18 R 0.068 0.019 0.120 0.204 0.103 0.109 0.377 19 K 0.105 0.010 0.101 0.228 0.120 0.123 0.313 20 R 0.203 0.017 0.076 0.180 0.121 0.113 0.290 21 I 0.286 0.033 0.043 0.151 0.103 0.051 0.334 22 S 0.328 0.026 0.034 0.138 0.061 0.052 0.361 23 L 0.177 0.010 0.105 0.261 0.086 0.199 0.163 24 G 0.197 0.007 0.090 0.171 0.118 0.279 0.138 25 M 0.355 0.017 0.063 0.156 0.108 0.088 0.213 26 I 0.483 0.022 0.036 0.148 0.056 0.047 0.208 27 N 0.502 0.009 0.040 0.146 0.066 0.061 0.175 28 T 0.553 0.007 0.053 0.142 0.065 0.042 0.138 29 V 0.637 0.014 0.020 0.120 0.045 0.027 0.137 30 V 0.651 0.013 0.018 0.113 0.039 0.021 0.144 31 S 0.601 0.018 0.012 0.080 0.052 0.033 0.204 32 L 0.302 0.016 0.012 0.058 0.105 0.074 0.434 33 D 0.088 0.012 0.007 0.030 0.009 0.058 0.796 34 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998