ClassName = DirichletReg Name = recode2.20comp Alphabet = ExtAA Order = A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y AlphaChar= 20 NumDistr= 20 Number= 0 Mixture= 0.0995105 Alpha= 7.18482 0.511263 0.0497959 0.649003 0.558417 0.0802515 0.64855 0.24822 0.0459505 0.670399 0.123161 0.0448623 0.769527 0.321419 0.4209 0.421573 0.92687 0.428882 0.0875678 0.0370602 0.141149 Comment= N S , Q K D H R E G T >< P A Y , W C M F , L V , I Number= 1 Mixture= 0.0915063 Alpha= 7.29117 0.446197 0.0947543 0.218246 0.338717 0.373937 0.213641 0.249149 0.588719 0.387644 0.844867 0.278515 0.251645 0.219581 0.313198 0.355993 0.39831 0.519313 0.672447 0.113698 0.412602 Comment= M Y H I L V T F Q W R >< K S A N E C P D , G Number= 2 Mixture= 0.079609 Alpha= 3.67235 0.0947443 0.0389985 0.00774231 0.0169605 0.240687 0.0259101 0.0194789 0.507358 0.0319864 1.79483 0.324273 0.0213416 0.0285095 0.0277275 0.0268589 0.032279 0.0486673 0.31005 0.0212982 0.0526529 Comment= L M , I , F V >< C , W Y A , T H Q P R K S N , G E , D Number= 3 Mixture= 0.0768909 Alpha= 7.45175 0.618733 0.0127998 0.412221 1.37156 0.0286604 0.120975 0.0997061 0.156732 1.22235 0.235644 0.0919333 0.260491 0.225424 0.72607 0.537742 0.449571 0.516668 0.317597 0.00792205 0.0389511 Comment= E K Q , R T A >< S D N P V H M , L I , G Y , F C W Number= 4 Mixture= 0.0694029 Alpha= 3.91972 0.463092 0.117251 0.02365 0.0525154 0.0764132 0.0564156 0.018391 0.698108 0.0431576 0.37326 0.111484 0.032638 0.0581999 0.0256344 0.0333495 0.0756702 0.288318 1.31914 0.0111326 0.0419 Comment= V , I , A C M T L ><, F P S Y , E W H G N K R Q , D Number= 5 Mixture= 0.0634561 Alpha= 3.92432 0.154238 0.0251039 0.0532682 0.123971 0.0337854 0.105151 0.119359 0.0763798 1.0839 0.158766 0.0518061 0.156833 0.0915554 0.250454 1.01562 0.141048 0.131415 0.0865516 0.0145151 0.0506025 Comment= R K ,, Q H >< N M T S A P E , L G Y I C V W , D F Number= 6 Mixture= 0.0624629 Alpha= 4.83932 0.293534 0.0135713 1.18747 1.47888 0.0353377 0.169386 0.069135 0.0465844 0.231654 0.0706524 0.0267783 0.194608 0.158031 0.278803 0.100976 0.214125 0.143915 0.0679679 0.0127722 0.0451413 Comment= E D ,, Q >< N A K S P H T , G R M Y , V W F L I C Number= 7 Mixture= 0.0621296 Alpha= 0.045907 0.00249218 1e-05 0.0070142 0.00426936 0.00336949 1.03968e-05 1.02816e-05 0.00101627 0.0024586 0.00365773 0.000853309 0.00357075 1.04207e-05 0.00178249 0.00463976 0.00302602 0.00249012 0.00199321 1.02479e-05 0.00322219 Comment= D R , Y N F E S Q >< T L K M A V , I ,,,, W , C H , P , G Number= 8 Mixture= 0.0610287 Alpha= 3.24295 1.41101 0.105557 0.0426692 0.0574157 0.0365642 0.347307 0.0230922 0.0378864 0.048845 0.078269 0.0462402 0.0369762 0.0940698 0.0407275 0.0354382 0.439769 0.155383 0.163156 0.00879767 0.0337825 Comment= A , S , C G >< T V M P , Q H Y E L F N K , R D I W Number= 9 Mixture= 0.0543999 Alpha= 4.33957 0.132027 0.0127901 0.0742548 0.0509784 0.0128061 3.5263 0.0256586 0.014052 0.0609331 0.0251185 0.00839744 0.0993639 0.0358504 0.0329582 0.0462887 0.0975612 0.0335997 0.0237746 0.00867912 0.0181797 Comment= G ,,,>< N , A S D H , K R Q E P C W T , Y M V F L , I Number= 10 Mixture= 0.0489669 Alpha= 3.681 0.212582 0.0613861 0.0961408 0.0894379 0.0310252 0.0888158 0.033723 0.0802437 0.0989861 0.075493 0.0410998 0.183153 0.0833837 0.0744273 0.0774646 0.897772 1.27525 0.13932 0.00915058 0.0321385 Comment= T , S , N >< C A Q V M , P K R D H E I G , L Y F W Number= 11 Mixture= 0.0429795 Alpha= 3.85394 1.3431e-06 0.0162595 0.00761351 1.34592e-06 0.108485 0.00408189 0.00722161 1.58328 0.0179102 0.629136 0.108321 0.00687457 0.0102488 0.0100627 0.0162242 0.00889559 0.0388115 1.2216 0.014111 0.0447914 Comment= I V ,, L M >< F , Y W , C T , R H K Q , P N S D ,, G ,,,,,,,,,,, E A Number= 12 Mixture= 0.0414635 Alpha= 2.7177 0.0719508 0.026763 0.771681 0.104034 0.0094394 0.231552 0.0688431 0.0205301 0.105887 0.0314134 0.00941251 0.681991 0.0620322 0.0480035 0.0326521 0.26723 0.111736 0.0247096 0.00678059 0.0310635 Comment= N D ,, S G H >< T K E , C P Q A Y R , W M L V I , F Number= 13 Mixture= 0.0368293 Alpha= 6.84011 0.297312 0.0185474 0.107205 0.145767 0.0342425 0.133391 0.0409215 0.0689044 0.157909 0.127703 0.0198322 0.0568499 4.92804 0.0780141 0.103916 0.233488 0.135802 0.113005 0.0081003 0.0311566 Comment= P ,,,>< A S , K T E R Q D G H , V L N I C M , Y F W Number= 14 Mixture= 0.0363754 Alpha= 3.65616 0.0778706 0.0523718 0.0406165 0.0489545 0.784283 0.0532739 0.216505 0.0707166 0.0593253 0.152484 0.0436315 0.0716277 0.0278345 0.0285473 0.0520619 0.087359 0.0626978 0.0824136 0.145133 1.49846 Comment= Y , F , W H ,>< C M , L N S I V T R A K , E Q G D P Number= 15 Mixture= 0.024047 Alpha= 3.21559 0.0581846 0.0229147 1.3443e-06 0.00394696 1.67169 0.00782033 1.35032e-06 0.198477 1.34466e-06 0.408982 0.096625 1.36412e-06 0.0270829 0.00708644 0.00811393 0.0266699 0.0289203 0.144973 0.117167 0.386926 Comment= F ,, Y W , L M I >< V , C , A P T S ,, Q R G , E ,,,,,,,,,, H , N , D K Number= 16 Mixture= 0.0211637 Alpha= 2.44312 0.128855 0.0456587 0.0391248 0.33421 0.0570425 0.0442709 0.194044 0.013113 0.146767 0.185141 0.118463 0.0968555 5.90055e-06 0.547907 0.206377 0.0466914 0.0579591 0.0655314 0.0383756 0.076732 Comment= Q , H M E , R W K >< C N L Y A F , T V S D , G , I ,,,,,,,,,,, P Number= 17 Mixture= 0.0103557 Alpha= 3.08024 0.0217332 2.87095 0.00736025 0.00383421 0.00693879 0.0127917 1.34374e-06 0.00731226 0.00529747 0.00782645 0.00491309 0.0105404 0.0138123 0.00509764 0.00683469 0.0250237 0.0247221 0.0395354 0.0018463 0.00386605 Comment= C ,,,,,><,, V T S , P A N M , G F R Q W D I Y , L K E ,,,,,,,,,, H Number= 18 Mixture= 0.0096244 Alpha= 2.8788 0.0229701 0.00414639 0.00937221 0.0135633 0.164104 0.0223014 0.0152213 0.0223818 0.0115382 0.076552 0.0151772 0.00889799 0.0094478 0.00588752 0.0342384 0.0215209 0.0190337 0.0222278 2.22921 0.151014 Comment= W ,,,,, Y F ><, L R , M H I , S T V A G E C P N K , D Q Number= 19 Mixture= 0.00779763 Alpha= 1.29622 2.16602e-06 2.16244e-06 0.0206068 2.17942e-06 0.0257429 2.47051e-06 0.963296 0.0135317 2.16539e-06 0.00638925 2.1414e-06 0.0786536 0.0173559 0.0445414 0.0251501 0.0241884 0.0133212 0.00810471 2.16433e-06 0.0553262 Comment= H ,,,, N Y >< Q , F R S P D , T I , V , L ,,,,,,,,, W C M ,, K E G A EndClassName = DirichletReg