ClassName = DirichletReg Name = recode1.20comp Alphabet = ExtAA Order = A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y AlphaChar= 20 NumDistr= 20 Number= 0 Mixture= 0.101329 Alpha= 7.35459 0.510802 0.0517214 0.69451 0.583786 0.0803611 0.628684 0.25567 0.0490105 0.697287 0.126215 0.0476718 0.819187 0.284091 0.431778 0.433125 0.933969 0.448068 0.0948067 0.0377109 0.146137 Comment= N S , D K Q H E R G T >< A P Y , W C M F , L V , I Number= 1 Mixture= 0.0882906 Alpha= 7.15046 0.436168 0.0991745 0.198722 0.299973 0.395186 0.211376 0.244201 0.616753 0.349254 0.872044 0.288453 0.236157 0.181199 0.28839 0.333866 0.372732 0.494724 0.68966 0.117475 0.424948 Comment= M Y H I L V F T W Q >< R S K A N C E P , D G Number= 2 Mixture= 0.0851849 Alpha= 0.0654145 0.00266 0.00141458 0.00759643 0.00466425 0.00344903 0.00752216 3.28829e-06 3.462e-06 0.00271281 0.00403705 0.000920365 0.00380695 0.00736316 0.00188546 0.00505385 0.00340902 0.00275532 0.00196849 0.000781308 0.00340748 Comment= P , D R G Y N F E C >< W S Q T L K M A , V ,,,,,,, H ,, I Number= 3 Mixture= 0.0783576 Alpha= 7.20571 0.581222 0.0137422 0.374837 1.33558 0.0349438 0.116926 0.107356 0.162298 1.17785 0.24252 0.0966803 0.239891 0.169877 0.723195 0.532136 0.413197 0.50293 0.31892 0.0113822 0.0502288 Comment= E K Q , R T A >< S D N H V M P , L I , G Y , F W C Number= 4 Mixture= 0.0746685 Alpha= 3.70146 0.0952475 0.0391654 0.00720656 0.0169086 0.247506 0.0236799 0.0183349 0.499415 0.0324136 1.82507 0.335398 0.0212006 0.026109 0.0280135 0.0263481 0.0321873 0.0479057 0.308153 0.0203441 0.050854 Comment= L M , I , F V >< C , W Y A , T H Q P R K S N , G E , D Number= 5 Mixture= 0.0713264 Alpha= 3.81273 0.429338 0.112874 0.0229647 0.0496503 0.0728641 0.0506888 0.0171595 0.70214 0.0427976 0.374816 0.108325 0.0321096 0.0463385 0.025077 0.0323295 0.0713899 0.279547 1.2948 0.00981266 0.0377149 Comment= V , I , A C M T L ><, F S Y P , E H N K W R Q G , D Number= 6 Mixture= 0.0601115 Alpha= 4.08686 0.159431 0.0249208 0.0550949 0.122558 0.0344013 0.0996602 0.117699 0.0804006 1.1602 0.166123 0.0543847 0.163653 0.079822 0.260622 1.06986 0.14714 0.136928 0.0884004 0.0140749 0.0514845 Comment= R K ,, Q H >< N M T S A , E L P Y I G V C , W D F Number= 7 Mixture= 0.0583377 Alpha= 5.01977 0.305294 0.0124772 1.24356 1.58089 0.0352006 0.163586 0.0703471 0.04795 0.242497 0.071076 0.0276444 0.192246 0.14161 0.295695 0.102919 0.216499 0.145393 0.0684032 0.0120843 0.0444012 Comment= E D ,, Q >< N K A S P H T , R G M , Y V W L F I , C Number= 8 Mixture= 0.057291 Alpha= 3.27547 1.47529 0.110268 0.041788 0.0549327 0.0367893 0.335992 0.0226366 0.0371333 0.0468927 0.0763811 0.0474042 0.0360923 0.0615244 0.0392106 0.0339743 0.447667 0.16027 0.168629 0.00821342 0.0343826 Comment= A , S , C G >< T V M , P Q H Y L E F , N K R D I W Number= 9 Mixture= 0.0489175 Alpha= 3.84309 0.163158 0.0153932 0.0915613 0.0617277 0.0134223 2.8552 0.0324048 0.0172924 0.0753669 0.0287865 0.009702 0.124348 0.0387352 0.0403074 0.0536557 0.122804 0.0412418 0.0278029 0.0102472 0.0199322 Comment= G ,,,>< N A S , D H K R Q E , P C W T Y , M V L F I Number= 10 Mixture= 0.0465481 Alpha= 3.92375 0.223111 0.0650139 0.100605 0.0937477 0.0327487 0.0903549 0.0346911 0.0849711 0.104194 0.0796375 0.0439315 0.195137 0.0643175 0.0786152 0.0818871 0.966123 1.39451 0.146329 0.0094345 0.0343942 Comment= T , S , N >< C A Q V M , K R D E H I P G , Y L F W Number= 11 Mixture= 0.0447385 Alpha= 3.36541 7.89447e-06 0.0116024 0.00658657 6.5223e-06 0.0996968 0.00424757 0.00532458 1.43574 0.0140583 0.572912 0.0974909 0.00526447 0.0126674 0.00829657 0.0140529 0.00629124 0.0265094 0.99123 0.0129041 0.0405259 Comment= I V ,, L M >< F , Y W , C T , R P K H Q , N D , S G ,,,,,,,,, A E Number= 12 Mixture= 0.0411747 Alpha= 5.48472 0.422539 0.0272212 0.153041 0.219595 0.0460588 0.185121 0.0546799 0.0970867 0.228286 0.164363 0.0272144 0.0895633 2.76727 0.110656 0.141892 0.336254 0.204188 0.160508 0.0118336 0.0373524 Comment= P ,,, A >< S K T E R Q , D G H V N L I , C M F Y W Number= 13 Mixture= 0.0365593 Alpha= 2.86216 0.0744122 0.0267541 0.873572 0.11826 0.00914647 0.212874 0.062258 0.0223467 0.103024 0.0315055 0.00943772 0.728656 0.054448 0.0459118 0.0279032 0.282754 0.118137 0.0249321 0.00563033 0.0301969 Comment= N D ,, S >< G H T E K , C Q P A Y , R M W I L , V F Number= 14 Mixture= 0.0349845 Alpha= 3.71674 0.0793978 0.0529955 0.0420262 0.0529031 0.801652 0.0522764 0.218391 0.068028 0.0617224 0.152064 0.0429137 0.0722317 0.0274016 0.0297779 0.0530894 0.0908508 0.0647677 0.0817896 0.143854 1.52861 Comment= Y , F , W H ,>< C M , L N S V T I R A K , E Q D G P Number= 15 Mixture= 0.0236972 Alpha= 3.14708 0.0548804 0.0216849 3.48567e-06 0.00308159 1.6574 0.00341853 3.49741e-06 0.188487 3.63837e-06 0.397976 0.0928569 3.53053e-06 0.0226471 0.00542551 0.00607073 0.0240679 0.0263777 0.138321 0.110433 0.393934 Comment= F ,, Y W , L M I >< V , C , A P T , S , Q R ,, E G ,,,,,,,, H , N K D Number= 16 Mixture= 0.0204447 Alpha= 2.49793 0.144568 0.0519646 0.0432687 0.317468 0.0621225 0.0455133 0.200393 0.00642119 0.130671 0.199813 0.124521 0.105937 0.00321538 0.545598 0.217976 0.0666782 0.0547647 0.0594838 0.0401209 0.077437 Comment= Q , H M E , R W C >< N L K Y A F , S T V D , G ,, I , P Number= 17 Mixture= 0.0104604 Alpha= 0.714385 1.00036e-05 1.00057e-05 0.0210222 0.000169372 0.0203075 1.00219e-05 0.418286 0.0115513 0.00881962 0.00719442 0.00122991 0.0654765 0.0144992 0.0359147 0.0250713 0.0202336 0.0121312 0.00636769 1e-05 0.0460708 Comment= H ,,, N , Y Q >< R F D , S P T I , K V , L M ,,,,, E , W , C ,, A G Number= 18 Mixture= 0.00908489 Alpha= 2.65655 0.0264112 0.00443166 0.00918038 0.0144688 0.186355 0.0227522 0.0186511 0.0251334 0.0129965 0.0871115 0.0170057 0.00900715 0.00927306 0.00647926 0.0365807 0.0231527 0.0209325 0.0250423 1.92978 0.171805 Comment= W ,,,,, Y F ><, L H M R , I T S V A , G E C K N P Q , D Number= 19 Mixture= 0.00849318 Alpha= 3.66507 0.02776 3.40896 0.00682175 0.00321389 0.0079819 0.0139024 3.50491e-06 0.00973183 0.00648156 0.00885337 0.00600777 0.0130565 0.0153979 0.00622522 0.0067207 0.0330919 0.0329325 0.0515923 0.00224296 0.00409093 Comment= C ,,,,,><,, V T S , A P N M , F G Q I W R D , Y K L , E ,,,,,,,, H EndClassName = DirichletReg